El puerto de Fremantle se encuentra a 20 km este de Isla Rottnest. Esto corresponde a una distancia de 11 millas náuticas.
El puerto de transbordadores de la isla de Rottnest conecta Australia con los puertos de North Fremantle, Perth, Hillarys y Fremantle, en el continente australiano. Las rutas Rottnest Island - Fremantle, Rottnest Island - North Fremantle, Rottnest Island - Hillarys y Rottnest Island - Perth son ofrecidas aquí varias veces al día por las navieras Sealink Rottnest, Rottnest Fast Ferries y Rottnest Express.